All modules for which code is available
- ppanggolin.RGP.genomicIsland
- ppanggolin.RGP.spot
- ppanggolin.align.alignOnPang
- ppanggolin.annotate.annotate
- ppanggolin.annotate.synta
- ppanggolin.cluster.cluster
- ppanggolin.edge
- ppanggolin.figures.drawing
- ppanggolin.figures.tile_plot
- ppanggolin.figures.ucurve
- ppanggolin.formats.readBinaries
- ppanggolin.formats.writeBinaries
- ppanggolin.formats.writeFlat
- ppanggolin.geneFamily
- ppanggolin.genome
- ppanggolin.graph.makeGraph
- ppanggolin.info.info
- ppanggolin.main
- ppanggolin.nem.partition
- ppanggolin.nem.rarefaction
- ppanggolin.pangenome
- ppanggolin.region
- ppanggolin.utils
- ppanggolin.workflow.panRGP
- ppanggolin.workflow.workflow