All modules for which code is available
- ppanggolin.RGP.genomicIsland
 - ppanggolin.RGP.spot
 - ppanggolin.align.alignOnPang
 - ppanggolin.annotate.annotate
 - ppanggolin.annotate.synta
 - ppanggolin.cluster.cluster
 - ppanggolin.edge
 - ppanggolin.figures.drawing
 - ppanggolin.figures.tile_plot
 - ppanggolin.figures.ucurve
 - ppanggolin.formats.readBinaries
 - ppanggolin.formats.writeBinaries
 - ppanggolin.formats.writeFlat
 - ppanggolin.geneFamily
 - ppanggolin.genome
 - ppanggolin.graph.makeGraph
 - ppanggolin.info.info
 - ppanggolin.main
 - ppanggolin.nem.partition
 - ppanggolin.nem.rarefaction
 - ppanggolin.pangenome
 - ppanggolin.region
 - ppanggolin.utils
 - ppanggolin.workflow.panRGP
 - ppanggolin.workflow.workflow